Gregor Mendel to dziewiętnastowieczny mnich augustiański, któremu przypisuje się odkrycie współczesnej genetyki. W grze Genotype wcielasz się w rolę jego asystentów, rywalizujących o zebranie danych eksperymentalnych na temat grochu, poprzez próby kontrolowania sposobu, w jaki rośliny dziedziczą kluczowe cechy po rodzicach: kształt nasion, kolor kwiatów, kolor łodygi i wysokość rośliny. Obserwowalne cechy rośliny grochu (jej fenotyp) są determinowane przez jej strukturę genetyczną (jej genotyp). Relacja między genotypem a fenotypem oraz natura dziedziczenia genetycznego stanowią sedno gry Genotype: A Mendelian Genetics Game.

Podczas gry gracze otrzymują karty roślin grochu, które pokazują zestaw cech fenotypowych, które chcą uzyskać i zebrać (takich jak różowe kwiaty i wysoki wzrost), aby zdobywać punkty. W każdej rundzie rzuca się kośćmi, aby przedstawić proces hodowli roślin, co może doprowadzić do uzyskania cech, których szukają gracze